辣椒碱来源于纯天然红辣椒，全身是宝，是一种高附加值新产品。其用途广泛，涉及医药保健、生物农药、化工涂料、食品保健以及军事弹药等多个领域，具有极高的药用价值和经济价值。
1. 医药领域
医学研究和药理临床实验表明，辣椒碱具有镇痛、止痒、抗炎、抑菌以及对心血管和消化系统的保护等作用。如辣椒碱对带状疱疹神经痛、外科手术神经痛、糖尿病神经痛等慢性顽固性神经痛以及关节痛、风湿病等有明显疗效；高纯度辣椒碱制成的戒毒针剂已经成为了一种广谱高效的戒毒新药；辣椒碱还有助于治疗各种瘙痒及皮肤病，如牛皮癣、荨麻疹、湿疹、瘙痒症等。近年来，很多学者发现辣椒碱的抑菌作用非常明显，并且能诱导早期和延迟心肌保护，还具有促进食欲，增强胃肠蠕动，改善消化功能的作用；同时进一步纯化的辣椒碱还能有效杀死癌细胞，减少细胞癌变的可能，开辟了癌症治疗的新途径。
2. 军事领域
辣椒碱因其自身无毒、辛辣刺激等特点，军事上常被用于制造催泪弹、催泪枪以及防卫武器的主要原料，在有些国家已得到广泛应用。另外，辣素会引发人体强烈的生理反应，使人产生咳嗽、呕吐、流泪等不舒服症状，因而可作为个人防身武器，或制服违法者。
3. 生物农药领域
辣椒碱辛辣、无毒，对有害生物具有良好的触杀、驱避作用。作为一种新型的绿色农药，有着其他化学合成农药不可比拟的优势，如药效高、持效长和可降解等特点，是 21 世纪新的环保型生物农药。
4. 功能涂料领域
将添加辣椒碱类化合物的生物防污涂料涂于船舶的外壳上，强烈的辛辣味可阻止海藻和海洋生物的附着，有效防止了水生生物对船舶的破坏，替代了有机锡防污涂料，减少了对海水的污染。另外，还可利用辣椒碱生产防蚁、防鼠的忌避剂，防止其对电缆食蚀伤害。目前中国已有人工合成辣椒碱应用于该领域。
5. 饲料工业
辣椒碱类化合物能改善动物的消化功能、促进食欲、增强血液循环，因此可作为食品健胃剂。如将辣素添加到饲料当中，将会弥补传统人工合成添加剂易对兽禽机体产生毒副作用、污染环境、危害人类健康等不足，还可以有效防治动物的腹泻和炎症等疾病。因此，添加辣椒碱类化合物的新型饲料将有极大的市场前景。
6. 食品行业
在人们日常生活中，低浓度的辣椒碱作为优良食品添加剂，应用已非常普遍，如各种辣味调味剂、辣味酱、红色素等。辣椒碱具有健胃、促进食欲、改善消化之功效。尤其是在南方潮湿的城市，人们更是每餐必吃，可帮助身体发汗。将从辣椒中提取分离出的辣椒碱作为食品添加剂，用于食品工业生产中，不仅实现了中国辣椒资源的有效利用，还保证了辣椒碱的充分吸收，同时对中国的食品加工行业意义深远。
7. 减肥保健领域
辣椒碱可以增强脂肪代谢能力，加快体内脂肪燃烧，防止其过多积聚，进而达到控制体重、减肥健美的目的。
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